Важным методом познания становится эксперимент (Галилей, Ньютон). Галилей изобретает телескоп, Левенгук — микроскоп. Эти изобретения значительно расширили область научных исследований. Человек стремится познать макромир и микромир. Важным методом познания становится аналитический, основанный на определении входящих в целое элементов.

В XVII в. наука приобретает коллективный характер. В Париже и Флоренции возникают академии наук, в Лондоне — Королевское общество. Они не только содействовали проведению исследований, но и публиковали научные труды, которые становились известны широкому кругу читателей. Наука начинает формироваться как социальный институт.

Возникает практика обмена знаниями между различными отраслями наук. Это позволило рассматривать изучаемые проблемы с различных точек зрения, значительно расширить сферу исследований. Рене Декарт (в латинской версии Картезий) внес немалый вклад в развитие философии, науки, духа рационализма в целом. Метафизика Декарта неразрывно связана с его научной деятельностью и разработанной им методологией, которая не только не отвергает опыт, но и считает его значение возрастающим по мере развития знаний. Методология Декарта связана с прогрессирующим разделением труда и стремлением найти общий метод, присущий многим наукам.

При этом философ ориентируется на математику, утверждая о существовании «всеобщей математики», которая одновременно является и «всеобщей мудростью». Декарт считал необходимым признание принципа очевидности, требуя проверять знания разумом. Основанием системы научного знания должно стать безусловно достоверное утверждение «я мыслю, следовательно, я существую». Он полагал, что существует два независимых начала — дух и материя.

В основу философии Декарт кладет не обезличенный процесс мышления, а процесс, в котором мышление составляет единое целое с мыслящим индивидом. В работе «Первоначальная философия» он указывает: «Под субстанцией мы можем разуметь лишь ту вещь, коя существует, совершенно не нуждаясь для своего бытия в другой вещи. Однако субстанцией, совершенно не нуждающейся ни в чем другом, может быть лишь одна, а именно Бог. Возможность же существования всех прочих субстанций мы можем постигать лишь при содействии Бога». Далее он пишет, что «телесную субстанцию и ум, или сотворенную мысленную субстанцию, можно подвести под общее понятие вещи, нуждающейся для своего существования лишь в содействии Бога». Мыслящая субстанция неделима. Телесная же имеет величину, ее возможно разделить. У Декарта математика стала наукой о телесном мире, отождествляясь с механикой.