Победа при Пелле и Скифополе обеспечила тыл арабских войск, стоявших в Джабии, и их продвижение в сторону Дамаска и Эмесы. Уже в январе 635 г. один арабский отряд появился вблизи Эмесы, и ее жители, не чувствуя себя в состоянии оказать арабам сопротивление, заключили с ними мир.

Однако затем к городу подошло ромейское войско под командой Ваана и правителя Эдессы Склира, и жители присоединились к нему, разорвав мирный договор. Дав бой арабам, Ваан отбросил их от Эмесы. При этом погиб эмир, командовавший арабским отрядом. Имени этого эмира источники не называют. Развивая наступление, Ваан прогнал арабов до Дамаска и укрепился на реке Барада (Варданисий). Тем временем остальные ромейские войска встретились с основными арабскими силами при Мардж-ас-Суффаре, где за год до этого потерпел поражение Халид-ибн-Саид. 25 февраля 635 г. здесь произошла вторая битва. Арабы одержали в ней победу, но понесли очень большие потери. Согласно преданию, сохраненному арабским историком IX в. ал-Балазури, битва была настолько ожесточенной, что потоки крови привели в движение мельницу. Очевидно, известие о поражении при Мардж-ас-Суффаре навело Ираклия на мысль, что удержать позиции у Дамаска не удастся, и он приказал Феодору и Ваану отвести войска к Эмесе. Однако дальнейшие события показали ошибочность этого решения императора. Потери арабов были так велики, что после битвы они 15 дней стояли на месте, видимо, ожидая подкреплений, и лишь в середине марта их основные силы осадили Дамаск. Несмотря на то, что войска Феодора и Ваана отошли к Эмесе, гарнизон и жители города оказали упорное сопротивление. Силы защитников Дамаска пополнились за счет воинов, бежавших сюда после поражения под Пеллой. Командование над ними принял правитель города Анастасий. Под его руководством город выдерживал осаду около 6 месяцев.