Цезарь официально возглавил армию святого престола, создал уникальную по тем временам разведывательную сеть и хитростью, подкупом и обманом покорил многие соседние княжества. Он стремился расширить церковное государство, а еще - создать свое собственное, которое бы заняло большую часть Апеннинского полуострова и играло решающую роль на европейской арене. На пути к цели его ничто не могло остановить. Ради этого он заключил союз с Францией и получил поддержку французских войск, с помощью которых захватил несколько мелких итальянских княжеств. Завоевательная политика требовала немалых средств, и Папа Александр VI любыми путями добывал их для сына. В ход шел и знаменитый яд Борджиа. Летописи утверждают, что именно в этот период при странных обстоятельствах умирали кардиналы, причем самые богатые из князей Церкви, и их имущество на законном основании переходило к Александру VI...

Когда расширившиеся владения Цезаря вплотную подступили к границам Флоренции, синьория - правительство республики - отправила «папскому сыну» посольство с целью разведать его дальнейшие планы, убедить не начинать военных действий против республики и согласиться на те небольшие уступки, которые предлагала Флоренция в обмен на союз с Цезарем. Возглавлял посольство опытный и хитроумный епископ Волтерра. Его сопровождал советник - ничем не примечательный мужчина лет тридцати с тонкими губами, длинным носом и пронзительным взглядом. Его звали Никколо Макиавелли. В своих отчетах он подробно и красочно описывал личность герцога, которого вскоре в своей знаменитой книге «Князь» представит образцом правителя. Вот одно из наблюдений Макиавелли: «Герцог - человек, который любит окружать себя тайной. Он не раскрывает ни одного намерения, пока не осуществит его». Как мы уже упоминали, большую роль в планах Цезаря Борджиа играла разведка. Когда агент выполнял свою миссию, он становился ненужным свидетелем и подлежал уничтожению. Примером этого может служить случай с Рамиро Лорка, который по приказу Цезаря убивал неугодных ему людей. За заслуги Рамиро Лорка был пожалован пост губернатора Романьи. Однако 23 декабря 1502 г. Макиавелли в своих записях отметил, что Рамиро «вчера прибыл из Пезаро, но не успел слезть с коня, как был заключен в тюрьму по приказу герцога. Тот может легко пожертвовать его жизнью, чтобы доставить удовольствие и заслужить расположение жителей страны, которые желают его гибели». Уже через три дня флорентийский посол отправил отчет, в котором упомянул: «Сегодня утром на городской площади нашли тело Рамиро, разрубленное на две части. Вокруг убитого собралась толпа людей. Очевидно, герцог хотел продемонстрировать, что может возвышать и приговаривать к смерти по своей воле».

Однако пройдет совсем немного времени, и хитрость и коварство Цезаря обернутся против него самого. После одного из пиров в Ватикане Цезарь и сам Папа Александр VI почувствовали себя плохо. Вскоре понтифик умер. Можно предположить, что причиной смерти стала лихорадка, но современники в один голос утверждали, что Папа и его сын стали жертвами собственного коварства - они случайно выпили отравленное вино, предназначенное для гостей. Более молодой и крепкий Цезарь сумел оправиться после отравления, но его тяжелая болезнь в момент смерти Папы разрушила все грандиозные замыслы герцога.

Непопулярность Папы Александра оказалась такова, что священники собора Святого Петра даже отказывались хоронить его в усыпальнице, расположенной в храме, а на отпевании присутствовали только четыре кардинала. Новым Папой Римским стал Юлий II, давний и непримиримый враг семейства Борджиа. Цезарь по его приказу был арестован, но сумел бежать. Однако жить ему оставалось недолго. 12 марта 1507 г. он попал в засаду около городка Виан. Борджиа яростно сопротивлялся убийцам, но ни мастерское владение клинком, ни удивительная сила и ловкость его не спасли. Когда израненное и покалеченное почти до неузнаваемости тело Цезаря было найдено, на нем оказалось двадцать пять тяжелейших ран, каждая из которых могла быть смертельной.