Половые и репродуктивные органы мужчины и женщины несут в себе глубокий символизм. Матка связана не только с деторождением, но и защитой, и с таинственными скрытыми силами. С ее символизмом связаны сосуды трансформации, котел и плавильный тигель, а также природные углубления, например, пещеры. Матка часто ассоциируется с богиней-матерью. Название древнегреческих Дельф, посвященных Великой матери-земли, моря и неба, где находился знаменитый оракул, происходит от греческого слова delphos, обозначающего матку.

Вульва также ассоциируется с богиней-матерью. В индуизме ее символом является йони, представленная в виде неглубокой чаши в форме вульвы и графическим символом треугольника. Племя бам-бара из Мали называет вульву «красивой большой матерью» и рассматривает ее как ворота, ведущие к спрятанному сокровищу и знаниям. Вульва символизирует темный, всепоглощающий аспект богини, ревнивой, излишне заботливой матери-собственницы, не отпускающей от себя детей, или женщины, удерживающей возле себя любовника. Понятие «зубастого влагалища» (vagina dcntata) может ассоциироваться именно с этим аспектом и представлять мужские опасения быть кастрированным - если он войдет в тело женщины, то уже не сможет убежать - и мужского страха поддаться своим инстинктам.

Фаллос - это символ мужского начала, активной энергии, возможности зачать ребенка и канал жизненной силы. Ему поклоняются во многих культурах как источнику жизни. В индуизме он ассоциируется с богом Шивой, его символом является линга, вертикальный камень, появляющийся всегда в соединении с йони. Этот союз символизирует единство духа и вещества, мужского и женского начал. Фаллическим предметам поклонялись в Древнем Китае. Японского бога супружества изображают в форме фаллоса. Боги плодородия, подобные древнеримскому При-апу, часто изображены с фаллосом в состоянии эрекции. С огромными эрегированными фаллосами изображали и сатиров, обозначая таким образом их сластолюбивую природу. Каббала рассматривает фаллос как элемент, поддерживающий равновесие. Становясь твердым или мягким с приливом энергии или с ее отливом, он остается балансирующим звеном, на котором держится мир.